2004年全国人体重要寄生虫病现状调查结果显示，我国包虫病流行区人群平均患病率为1.08%，估计受威胁人口数约为5000万，推算全国包虫病患者数约为38万。2012年全国包虫病流行情况调查结果显示，我国有350个县流行包虫病，人群包虫病患病率为0.24%，患病人口总数约为11万（除西藏外）。

随着2015-2016年内蒙古和云南，2016年西藏完成包虫病流行情况调查，得出了我国最新的包虫病流行情况结果。截至2016年底，我国包虫病流行县超过了360个，受威胁人口超过5000万，人群患病率为0.34%，患者总数约为17万。其中，泡型包虫病流行县为119个，分布于西藏、四川、青海、甘肃、宁夏和新疆。

在所有省份当中，西藏、四川和青海包虫病患病率位居前三。综合2012年和最新调查结果显示，西藏全区74个县均有包虫病流行，其中发现泡型包虫病的县有47个，占64%。

从最新的调查结果和国际研究报告来看，我国需要进一步加强包虫病防控工作，防控的重点是西部农牧区的360多个县，特别是四川、青海、西藏、甘肃四省藏区。