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“果蔬杀手”橘小实蝇最完整基因组图谱发布

2025年12月05日 14:45  |  作者:高志民  |  来源:人民政协网 分享到: 

人民政协网12月4日电(记者 高志民)中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心)王桂荣课题组联合崔鹏课题组以“果蔬杀手”橘小实蝇为研究对象,成功构建了迄今为止在小个体高杂合害虫中最完整的基因组图谱。该研究不仅填补了橘小实蝇现有参考基因组中缺失的片段,证明了小个体昆虫能够迈入T2T基因组时代,为发现基于害虫功能基因组学手段的防控分子靶标提供了新思路。

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橘小实蝇,因其食性杂、寄主广、繁殖力强,被称为果蔬界的“头号杀手”。基因组图谱是解析橘小实蝇生理特性,开发针对性绿色防控技术的基础。现有橘小实蝇参考基因组大多基于混合个体组装,尤其是在中心粒、性染色体这些区域有较多的“空白”。

研究团队综合利用多种三代测序技术,以单个体雄虫的测序数据作为基本骨架,整合群体数据,成功组装出了大小近600Mb的基因组。与其他橘小实蝇基因组参考版本相比,新的基因组版本首次实现了从端粒到端粒的无缺口完整覆盖,填补了以往基因组中高度重复的复杂区域留下的空白。研究在此基础上进一步解析了中心粒,性染色体等高重复结构区域,挖掘出了Y染色体特异性基因和气味受体等潜在的绿色防控技术靶标,为害虫绿色防控技术的研发与优化提供了高质量参考基因组资源。

该研究得到深圳市科技计划资助,深圳市大鹏新区科技创新和产业发展专项资金资助项目,国家重点研发项目,中国农业科学院科技创新工程,国际原子能机构协调研究等项目支持。相关研究成果发表在《自然通讯(Nature Communications)》上。

编辑:马嘉悦