台湾地区是深圳市第五大贸易伙伴、第一大进口来源地。据海关统计，2016年，深圳市对台湾地区进出口总值2081.2亿元人民币，比2015年增长2.9%，增速较2015年提高1个百分点。

据深圳海关综合统计处分析，民营企业对台进出口大幅提升是增长的主因。统计显示，2016年深圳市民营企业对台湾地区进出口1101.4亿元，增长12.8%，占比52.9%，比重较2015年增加4.7个百分点。同期，外商投资企业和国有企业进出口值降幅均在3%以上。

从出口产品类别来看，机电产品是主导。2016年，深圳市对台出口机电产品98.4亿元，下降10.2%，占深圳市对台出口总值的78%。同期，对台出口传统劳动密集型产品7.5亿元，增长10%，其中塑料制品、家具增长较快。

进口仍然以机电产品为主。2016年，深圳市自台进口机电产品1780.7亿元，增长4.3%，占深圳市自台进口总值的91.1%，主要包括集成电路、液晶显示板、二极管、印刷电路等。同期，自台进口农产品4.6亿元，增长5.8%。