西畴高原鳅的主要鉴别特征如下：眼睛高度退化为一个细小的眼点，背鳍起点前于腹鳍起点，背鳍起点距离吻端的距离近于尾鳍基部，尾柄细长，身体光滑无鳞，鳔后室发达，长椭圆形，肠短，呈“Z”折叠于胃的后方。

中国科学院昆明动物研究所系统进化与生物地理学研究组的研究人员表示，中国已记录分布有100多种洞穴鱼类，物种多样性具世界首位。按照生活史的全部或部分需要在黑暗的洞穴或地下水环境中完成，中国学者将洞穴鱼类分为典型洞穴鱼类、非典型洞穴鱼类和偶入洞穴鱼类。高原鳅属隶属于鲤形目，条鳅科，为条鳅科最大类群，目前已知有120余种，其中洞穴种类约有26种(含本新种西畴高原鳅)。

研究人员表示，西畴高原鳅的发现丰富了我国洞穴鱼类的记录，同时也揭示了西畴县极其特殊的生物多样性。该研究得到了国家自然科学基金、云南省科学技术项目、中国科学院东南亚生物多样性研究中心的资助。